在生物体内，细胞通过不同的代谢过程来获取能量，而有氧呼吸是其中最为高效的一种方式。有氧呼吸是指在氧气存在的条件下，细胞将有机物彻底氧化分解，释放出大量能量，并生成水和二氧化碳的过程。这一过程主要发生在细胞的特定结构中，通常被分为三个主要的场所。

首先，细胞质基质是进行有氧呼吸的第一阶段——糖酵解的地方。在这个过程中，葡萄糖被分解为丙酮酸，并产生少量的ATP和还原型辅酶（NADH）。这个阶段不需要氧气的参与，但为后续的有氧呼吸提供了重要的中间产物。

其次，线粒体基质是进行三羧酸循环（也称为柠檬酸循环）的主要场所。在这一阶段，丙酮酸进入线粒体后被进一步分解，产生二氧化碳、NADH和FADH₂等高能物质。这一过程虽然不直接依赖氧气，但它为后续的电子传递链提供了关键的原料。

最后，线粒体内膜则是进行电子传递链和氧化磷酸化的地方。在这个阶段，NADH和FADH₂将电子传递给一系列的载体蛋白，最终将电子传递给氧气，生成水。同时，这一过程会驱动质子泵入线粒体膜间隙，形成质子梯度，从而通过ATP合酶合成大量的ATP。

综上所述，有氧呼吸的三个主要场所分别是：细胞质基质、线粒体基质和线粒体内膜。这三个场所各司其职，协同完成从葡萄糖到ATP的能量转化过程，为细胞提供持续而高效的能源支持。